multiwfn新上映_multiwfn software(2024年12月抢先看)
찟 计算化学服务:专业代算,精准高效 专业计算化学代算服务 拥有985化学博士背景,我们提供专业的计算化学代算服务。已发表七篇一区论文,专注于DFT及分子动力学研究。 ️ 掌握多种计算软件: Gaussian ORCA Multiwfn PSI4 GROMACS ️ 熟练运用画图软件: Chemdraw VMD Origin 젥黎🦎姚计算任务包括: 结构优化、频率计算、构象搜索、电荷分布、HOMO/LUMO及其他轨道分析、偶极矩、极化率和超极化率、Fukui函数、静电势、成键分析(拓扑分析、盆分析等)、轨道分析(NOCV等)、弱相互作用分析(RDG、IGM等)、能量分解、结合能计算。 核磁计算、EPR计算;AICD;红外和拉曼光谱;紫外/可见吸收光谱、荧光发射波长、激发态能级、旋轨耦合常数、重组能、圆二色谱(ECD/VCD)、振动耦合的光谱;激发态电子结构分析(NTO、空穴/电子分析等)。 过渡态搜索、势能面扫描、反应机理拟定和计算研究;高精度热力学量计算。 服务范围广泛,包括但不限于:计算、作图以及期末大作业等。价格公道,服务到位!
电解液模拟:揭秘溶剂化 今天想和大家分享一个关于电解液分子动力学模拟的有趣案例,特别是关于锂溶剂化的部分。这个项目是我们团队和合作伙伴一起完成的,整个过程还是挺有意思的。下面我会详细介绍一下整个模拟的步骤。 准备工作 首先,模拟前的准备工作非常重要。你需要确认力场,通过文献调研获取各种溶剂、添加剂以及阴阳离子的力场参数。离子的电荷是通过RESP方法计算得到的,用的是Gaussian结合Multiwfn程序。而中性溶剂的电荷则是通过1.2*CM5的方法得到的。把这些计算好的电荷填入对应的ITP文件。 建模 ️ 接下来是建模部分。根据电解液中的各种溶剂和离子的摩尔数比(或者摩尔浓度比),我们用Packmol软件生成对应的PDB文件,并导出GRO文件。GRO文件的末尾规定了整个盒子的三维尺寸。 模拟运行 ♂️ 模拟过程通常分为三个主要步骤:能量最小化、预平衡和正式生产模拟。预平衡可以用NVT和NPT相结合的方法,使得整个电解液体系更快地达到稳定状态。平衡后,再进行5-10ns的正式生产模拟阶段(正常控温控压),数据分析则用最后阶段的轨迹进行。 数据分析 数据分析是整个模拟过程中最有趣的部分之一。我们通常采用最后一个阶段的轨迹进行分析。常见的分析数据包括径向分布函数(RDF)、均方位移和扩散系数(MSD)、平均配位数(CN)。通过这些数据,我们可以分析锂离子周围的溶剂化作用强弱。进一步,我们还可以根据距离远近和作用强弱,把锂离子的溶剂划分为不同的溶剂化模型,比如AGG、CIP和SSIP等。 溶剂化结构的探索 最后,我们还可以对最后一个阶段的轨迹进行分析,遍历每一帧,对每一帧中所有的锂离子周围的溶剂情况进行分析和汇总。比如说,1号锂离子周围有2个EC分子、1个PF6阴离子。然后将所有的情况进行统计归纳,就可以得到整个电解液中最有可能存在的溶剂化结构。 总的来说,分子动力学模拟是一个非常强大的工具,可以帮助我们理解和预测复杂体系中的各种现象。如果你对这个领域感兴趣,欢迎讨论和交流!
写这个东西并不只是为了说三硝基胺,更多的是为了批评高中和大学本科无机化学,结构化学中大东西被不加思考的滥用这一问题,文中的内容以计算为主,适当会补充一些定性的理论知识 使用的计算化学工具:Gaussian16,ORCA,molpro,psi4,Multiwfn 2L开始说事情
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